日志 2012-07-28

分子模擬:

  1. (Klniu,Robot, /home/klniu/new1/md/card0_me_ccocs/300_544_100),10*10, 544,水、油層的高度均為5nm,這個體系比較大,npt_first結果出現,但只是平衡階段,不過看了下結果,體系大了,平衡非常快,密度曲線也比較漂亮整齊。
  2. (Lab1, /home/klniu/md/card0_me_ccocs/300_198_new),6*6、198的界面張力體系開始,因為上次此機器所做的多加了2個NaCl,這一次校正過來,看結果。npt_ext7完成,npt至ext7的界面張力為: -351、-501、-105、-231、-185、34、219、202 bar/nm,5ns數據。這個模擬延長,主要觀察其界面張力RMSD會不會隨著模擬時間的加長而減小。
  3. (Lab2, /home/klniu/md/card0_me_ccocs/300_196_new),6*6、196的界面張力體系開始,因為上次此機器所做的多加了4個NaCl,這一次校正過來,看結果。npt_ext7完成,npt至ext7的界面張力為: 204、-191、8、12、-148、-203、-327、-314 bar/nm,5ns數據。這個模擬准備停止,開始一個新的模擬,下面有說明。
  4. (Lab2, /home/klniu/md/card0_me_ccocs/300_1232_225),15*15、1232的界面張力體系開始,這個體系很大,是在10*10的基礎上放大的,其他參數未變,考察其界面張力波動情況。

生活:

  1. 昨晚打坐50分鐘,一般。懈怠次數從2012-07-19開始:0;因事耽誤次數從2012-07-19開始:0;今天所因事由:無。

讀書:

  1. 繼續《論語別裁》《論語譯注》。
  2. 繼續散讀《平凡的世界》、《西游記》。

作者: 勿慢牛

安全方向,化學/化工專業,主要關注學佛、計算化學、C++、Python、計算機、古文化、哲學、思維方向,渴求與有共同興趣的朋友交流,詳情請查看“關于”頁面。

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