日志 2012-05-21

分子模擬:

  1. 經過一個周末的模擬,68個表活劑3.5*3.5的盒子的體系模擬已經到ext9了,但界面張力有時候會跳動,還不平衡,繼續模擬,而且現在界面張力有增大的傾向,因此有可能不需要68個,比如只需要60個就能達到穩定的最小界面張力,雖然此界面張力和實際值相差較遠。這是因為在模擬初期,68的雖然有時候會很低,但最後還會變大,而小數量的一直很穩定,而且很快會平衡。這幾天再校驗一下。
  2. mdtool.py的重構已經進入後期測試階段,預計兩天之後就能使用。

作者: 勿慢牛

安全方向,化學/化工專業,主要關注學佛、計算化學、C++、Python、計算機、古文化、哲學、思維方向,渴求與有共同興趣的朋友交流,詳情請查看“關于”頁面。

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