日志 2011.12.08

如果没有强大驱动力的事情,还是暂时不要做的好,这个驱动力可以是好奇心或各种压力,因为在没有这些驱动力的情况下,我往往半途而废,而且在此期间会寻找各种借口来摆脱现在这个事情,也可以说,这个事情还没紧急到现在必须要做的地步。 分子动力学模拟:模拟300万步后密度的两个峰还不对称,增加100万步后对称了,现在npt1(N,P)增加到400万步,pro用300ps。

日志 2011.12.07

分子动力学模拟:今天出现了第一个结果,343_Na_01,界面张力值合理,但还不知道与其他组结果出来后符不符合规律,DRG的密度峰很不对称,一高一低,难道还不平衡,在pro加100万步验证一下。 生活:昨天煮粥放放了,好稠的粥,因为水太少,没有红豆煮熟,555还好没吃拉肚子~~~ 生活:电信挺给力,在开学的时候花200大洋买的华为c8650手机,老是举办活动,昨天开始又送礼包,包括电池、4G内存卡、座充,现在三块电池了。我感觉我是托,不过真的挺不错。只是感叹联通为什么不着急,信号不好,服务还不好。 读书:昨晚继续读《越读者》,现在已经开始摸索自己的读书方法,思维导图记大纲,主旨放wiki里,还可以打印。

日志 2012.12.06

分子动力学模拟:模拟现在需要进行400万多万步,时间长了些,不过这么多步骤总算是平衡的,现在开始生产,希望数据能有规律,想写文章了,拖这么久了,心都有点累了。 生活:前几天在当当网买的小电炖锅昨天到了,这个功率真小,寝室肯定不会跳闸,昨晚用它炖了一锅粥,挺好,不过煮了两个小时,放入时水不怎么热,今天用开水试试,呵呵,一小碗粥,一本书,生活何其幸福!

日志 2011.12.05

分子动力学模拟:总算摸索出来一条路了,前几天的模拟很顺利,压力波动已经不大,界面张力大部分也合理,但仍有负值,经考察,是平衡时间不够的问题,继续增加100万步,查看效果。 今天帮一位女同学修电脑,她比较客气,买了些水果和水来感谢,我挺不好意思的,实际上,一般比较客气的人我反而感觉很紧张,总怕帮她们做不好,哎,大家有此心即可,至少让我感觉自己的努力受到感谢了,不需要物质感谢的,拒绝了却拗不过,呵呵。

日志 2011.12.02

分子动力学模拟:今天使用semiisotropic nvt_pr(b,5万步), npt_pr(b,b,5万), npt(b,b,100), npt(n,p,100),压缩系数均为4.5e-5,最后一次了,如果还不能过,就不再尝试了,放弃gromacs对界面张力的探索 mediawiki 1.18和masseditregex不兼容,作者已经说明,在1.19会好用,在本地架设个服务器用1.17的先把分类系统应用起来,之后再传数据库文件到服务器上使用。 读书: 如何阅读一本书

日志 2011.12.01

分子动力学模拟:semiisotraphic, z轴压缩系数为0的模拟,npt(berendsen)还不平衡,测试在些条件下平衡之后再使用N-P的控温控压系统 正在建立分类系统,并修改了部分wiki的分类,以后的分类也将依照这个分类系统进行分类

日志 2011.11.30

分子动力学模拟:应用semiisotropic,Z轴压缩系数设置为0。增加一个40万步的berendsen控温控压过程,查看压力涨落与张力是否合理。 维基:更新至1.18.0,同时使用一些Gadgets小工具,增强编辑功能,很强大。 贪婪:如果有一个类似kindle的电子书,同时有强大的笔记功能,还能外接键盘,那就爽了。

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